মদনমোহন কলেজ

• রসায়ন বিভাগ
• পদার্থবিদ্যা বিভাগ
• গণিত বিভাগ
• পরিসংখ্যান বিভাগ
• আইসিটি বিভাগ

• ব্যবস্থাপনা বিভাগ
• অ্যাকাউন্টিং বিভাগ
• অর্থ ও ব্যাংকিং বিভাগ

• অর্থনীতি বিভাগ
• রাজনৈতিক বিজ্ঞান বিভাগ
• উন্নয়ন গবেষণা বিভাগ

• বোটানি বিভাগ
• প্রাণিবিদ্যা বিভাগ

• বাংলা বিভাগ
• ইংরেজি বিভাগ
• ইসলামী শিক্ষা বিভাগ
• দর্শনশাস্ত্র বিভাগ
• ইসলামী ইতিহাস ও সংস্কৃতি বিভাগ

বর্তমানে কলেজে বেশ কয়েকটি একাডেমিক ভবন রয়েছে। এ ভবনগুলো প্রধানত শ্রেণীকক্ষ, লাইব্রেরী ও প্রশাসনিক কাজে ব্যবহার করা হয়। এগুলোর মধ্যে রয়েছে মোহিনীমোহন ভবন, যোগেন্দ্রমোহন ভবন, এম. সাইফুর রহমান ভবন, একাডেমিক ভবন (প্রস্তাবিত), একাডেমিক ভবন তারাপুর ক্যাম্পাস।

কলেজটির একাডেমিক ভবনের নিচতলার উত্তরাংশে সুবৃহৎ গ্রন্থাগার রয়েছে, যেখানে প্রায় পঁচিশ হাজার দুষ্প্রাপ্য ও গবেষণাধর্মী গ্রন্থসমাবেশ রয়েছে।